Про це повідомляє офіційний сайт клубу «Мінськ».
Ковтун - вихованець київського «Динамо», де і почав свою кар'єру в юнацьких і молодіжних командах. Згодом приєднався до юнацької команди «Металіста», де провів два наступні сезони.
Потім захисник перейшов у «Полтаву», де за три сезони Ковтун провів 69 матчів і забив 3 голи.